Có thể gọi đó là bệnh thối ngọn hoặc thối đầu cành. Bệnh do nấm Alternaria sp. gây ra. Ngọn, cành thanh long bị bệnh chuyển màu vàng, mềm ra, sau đó bị thối. Cây bị bệnh phát triển chậm, số cành giảm hẳn. Bệnh thường phát sinh vào đầu mùa mưa.

Khi phát hiện mới có bệnh dùng các thuốc Bendazole, Viben-C, Vimancoz, Vithi-M, Topsin-M, Manozeb, phun ướt đẫm các ngọn và cành cây. Các thuốc này cũng phòng trừ được nhiều bệnh khác trên cây thanh long.