Có hai mô hình tổ chức quản lý công ty TNHH một thành viên:

- Mô hình Hội đồng quản trị: gồm Hội đồng quản trị và Giám đốc (Tổng Giám đốc).

- Mô hình Chủ tịch công ty: gồm Chủ tịch công ty và Giám đốc (Tổng Giám đốc).

Trong trường hợp công ty có quy mô kinh doanh lớn, ngành nghề kinh doanh đa dạng thì nên lựa chọn mô hình Hội đồng quản trị. Tuy nhiên, đây không phải là một quy định bắt buộc.

Quyền và nghĩa vụ của các chức danh quản lý nêu trong hai mô hình trên do chủ sở hữu công ty quy định tại Điều lệ công ty. Điều 17, Điều 18 Nghị định 03/2000/NĐ-CP đã quy định các quyền và nghĩa vụ cụ thể của các chức danh quản lý này