Trong trường hợp này, vai trò chỉ đạo của cơ quan nhà nước chỉ được thực hiện với tư cách là một cổ đông thông qua người đại diện, không thể can thiệp trực tiếp bằng các mệnh lệnh hành chính như đối với doanh nghiệp nhà nước. Công ty cổ phần không có cơ quan chủ quản như doanh nghiệp nhà nước, Đại hội đồng cổ đông gồm tất cả các cổ đông có quyền biểu quyết là cơ quan quyết định cao nhất của công ty cổ phần (Điều 70 Luật Doanh nghiệp).