Hiện nay các trại chăn nuôi đều sử dụng nước giếng ngầm, vì nguồn nước này rẻ tiền, ổn định. Tuy nhiên, Tùy vào nguồn nước của mỗi vùng mà khi sử dụng ta cần chú ý một số yếu tố sau:

- Hàm lượng kim loại trong nước giếng rất cao, như sắt, nhôm,… nếu không lắng lọc tốt sẽ ảnh hưởng đến sức khỏe của heo và ảnh hưởng đến các thuốc khi pha vào nước.

- Độ pH (hay còn gọi là độ phèn)của nước biến động nhiều, có khi pH quá cao hoặc quá thấp điều không tốt cho heo. Nước uống của heo có độ pH tốt nhất khoảng 7-8.

- Nên định kỳ kiểm tra chất lượng nước về một số chỉ tiêu, như: vi sinh, hàm lượng kim loại, … nhất là đối với những giếng sử dụng lâu năm.

- Thường xuyên khử trùng nước uống và định kỳ vệ sinh khử trùng đường ống bằng thuốc Aquasept hoặc Virkon để hạn chế mầm bệnh có trong nước và những hợp chất bám lâu ngày bên trong lòng ống dẫn nước.

- Khi pha thuốc vào nước nên chia làm nhiều lần để hạn chế thuốc hao hụt do tác dụng với một số kim loại có trong nước.

Tóm lại: Nếu có qui trình lắng, lọc và xử lý thích hợp thì nguồn nước sẽ được sử dụng tốt trong chăn nuôi.