Đối với một trại heo giống thì việc định hướng và thiết kế một hệ thống giống là công việc rất quan trọng, nó có ảnh hưởng quyết định đến sự tồn tại và phát triển của trại đó. Các bước thiết lập hệ thống giống có thể hình thành ngay khi trại mới hoạt động hoặc phát sinh trong quá trình hoạt động do nhu cầu của thị trường hay do những yêu cầu nào khác của khu vực. Từng bước trong quy trình thiết kế như sau:

- Xác định và quyết định mục tiêu cuối cùng của trại giống, nghĩa là xem con giống sản xuất ra để đáp ứng cho như cầu nuôi thương phẩm hay tiếp tục làm giống. Sau đó chọn tiếp tục ưu thế lai phù hợp.

- Xác định con đực giống của trương trình cải tạo giống hay nhân giống. Việc này đóng vai trò rất quan trọng và cần phải có những tính toán thật tỉ mỹ trước khi đưa đực giống vào hoặc nhập tinh của đực giống.

- Xác định cách để thay thế đàn nái và đàn đực giống khi cần thiết.

Các bước trên được dự trù cảng tốt thì hiệu quả hoạt động của trại sẽ có định hướng tốt hơn và có thể có được những phương án thay thế khi có những trở ngại xảy ra