Men trong ruột chịu trách nhiệm tiêu hóa protein. Nó được tiết ra bởi tuyến tụy tạng nhưng ở trong dạng không hoạt động nó được gọi là trypsinogen. Sự kích hoạt để nó hoạt động xảy ra chỉ ở trong ruột non, nhờ tác động của men khác được tiết ra bởi thân ruột lá. Không giống như men tiêu hóa pepsin được tìm thấy trong dạ dày, trypsin không đòi hỏi môi trường axit