Heo con mới đẻ ra không có hậu môn chủ yếu do các yếu tố di truyền:

Đồng huyết, heo nọc và heo nái được phối có liên hệ thân tộc gần. Điều này có thể quan sát thấy được khi có kèm theo các dị dạng khác, hoặc nhiều heo bị tình trạng này có liên quan với một heo nọc nào đó.

Đột biến trong di truyền. Tỉ lệ này ít và không kèm theo các dị dạng khác, hoặc xảy ra trong cùng một heo nọc.

Ngoài ra còn có thể do cá thể trong thời gian hình thành các bộ phận của bào thai. Tỉ lệ này rất thấp.

Cách xử lý: Có 2 dạng không hậu môn: (1) Không có trực tràng, (2) Có trực tràng. Trường hợp có trực tràng thì phẫu thuật tạo vòng hậu môn. Nếu không có phải phẫu thuật vào tạo trực tràng giả bằng ống nhựa. Tuy nhiên, trường hợp không có trực tràng thì can thiệp không hiệu quả.

Đối với heo cái, phân có thể đi chung với đường sinh dục và heo phát triển bình thường.

Đối với heo đực: phẫu thuật là biện pháp bắt buộc, nếu không heo có thể bị chết vào ngày 7-10 ngày sau khi đẻ.