Để phẫu thuật an toàn và có được hiệu quả phẫu thuật như ý, đối với trẻ nhỏ bị sứt môi bẩm sinh, người ta thường chủ trương phẫu thuật khi trẻ được 3  - 6 tháng tuổi, thời gian cụ thể nên xem xét tình trạng sức khỏe của trẻ để quyết định, thường yêu cầu thể trọng của trẻ mắc bệnh phải đạt 4,5 kg trở lên, hồng huyết cầu đạt 10g trở lên. Về thời gian phẫu thuật hở hàm ếch bẩm sinh hiện vẫn còn tranh luận, có người chủ trương phẫu thuật sớm, để có thể giúp trẻ phát dục bình thường và tránh dị thường cho cơ quan phát âm; nhưng lại có người cho rằng phẫu thuật sớm có thể ảnh hưởng đến phát dục của xương hàm trên, tỉ lệ tử vong tương đối cao; cũng có người chủ trương phân thời kỳ phẫu thuật, trước tiên sửa chữa phục hồi phần sụn vòm hàm trên, sau một thời gian mới sửa chữa phục hồi phần cứng của hàm trên. Hiện  nay, ở Trung Quốc thường để trẻ khoảng 2 tuổi mới tiến hành phẫu thuật sửa chữa phục hồi hở hàm ếch