Viêm khớp dạng phong thấp ở trẻ nhỏ là một bệnh mạn tính, diễn biến về sau thường khá tốt, ít nhất có 75-85% số người bệnh sau khi phát bệnh 1 lần hoặc nhiều lần lại thuyên giảm trong một thời gian dài, không để lại di chứng hoặc có rất ít khớp bị biến dạng và trở ngại chức năng. Đối với viêm khớp phát tác nhiều lần, nếu dùng thuốc thay đổi bệnh trình kịp thời vẫn có thể ngăn chặn bệnh tình phát triển, diễn biến về sau cũng tốt. Trẻ bị viêm khớp dạng phong thấp toàn thân trong quá trình mắc bệnh, nếu không có cơ quan nội tạng bị tổn thương nghiêm trọng do thuốc gây ra thì diễn biến về sau cũng khá tốt