Viêm đường niệu trong chứng tổng hợp Reiter xuất hiện ở 68% số người bệnh thông thường trong một thời gian ngắn, tần suất đi tiểu nhiều hơn thời gian 1-5 ngày (tức số lần đi tiểu tăng, nhưng lượng nước tiểu trong mỗi lần lại không nhiều) và đi tiểu thấy đau. Có thể cho thấy chất tiết ra có mủ hoặc chất dò rỉ có dạng nước lõang rõ rệt. Đầu đường niệu có thể thấy mụn ban đỏ, phù thũng hoặc loét nhẹ. Trong thời gian bị chứng viêm, kiểm tra nước tiểu thông thường có thể phát hiện thấy một lượng nhỏ bạch cầu và anbumin. Người bị viêm đường niệu nhẹ có thể không cần chú ý đến, không cần điều trị, chỉ vài ngày sau có thể tự khỏi. Một sống người bệnh có triệu chứng nặng có thể kéo dài đến 1 tháng. 20% số người bị chứng tổng hợp Reiter có thể xuất hiện viêm tiền liệt tuyến, viêm bào quan có xuất huyết, viêm túi tinh và viêm tinh hoàn