Chứng tổng hợp Reiter phát bệnh lần đầu tiên thường thể hiện là một quá trình mang tính tự giới hạn, thường trong vòng 1-3 tháng, những triệu chứng của người bệnh sẽ tự mất đi, triệu chứng viêm khớp ngoài cột sống hoàn toàn mất đi, bệnh biến niêm mạc da sau khi điều trị khỏi không để lại sẹo. Nhưng theo các báo cáo nước ngoài, ½ các ca bệnh thường bị tái phát. Người bị tái phát không nhât định bị nhiễm khuẩn đầu tiên, cũng không nhất định phải có 3 chứng liên kết: viêm đường niệu, viêm kết mạc và viêm khớp. Biểu hiện chủ yếu của tái phát bệnh: một là viêm khớp tái đi tái lại hoặc viêm khớp mạn tính, cuối cùng có thể dẫn tới phá họai xương sụn  của khớp và sinh dị hình khớp; hai là viêm thể lông mi của hồng mạc tái phát, có thể dẫn tới trở ngại thị lực, thậm chí bị mù. Trong tỉ lệ phát sinh viêm mắt kiểu này chỉ chiếm một tỉ lệ rất ít trong số những người mắc chứng tổng hợp Reiter.

Ở Trung Quốc vẫn thiếu những báo cáo theo dõi trong thời gian dài đối với những người mắc chứng tổng hợp Reiter, vấn đề có tái phát hay không vẫn đang chờ nghiên cứu