Cho tới gần đây các thầy thuốc thực hành khuyên chỉ nên dùng tới một lọai thuốc tên là zidovudin để điều trị HIV. Tuy nhiên, có một vài nghiên cứu gần đây chỉ ra rằng dùng một loại thuốc sẽ làm tăng khả năng kháng thuốc của virus. Vì vậy, người ta khuyên nên dùng hai hay ba lọai thuốc để điều trị có hiệu quả HIV.

Các thuốc nên dùng điều trị nhiễm HIV có thể chia làm ba nhóm :

Các nhóm ức chế men sao chép ngược trong nhân tế bào còn được gọi tắt theo tiếng anh là NRTIs (Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors)

Các thuốc này làm gián đoạn quá trình nhân lên của virus từ giai đoạn sớm . Các thuốc có thể làm chậm lan truyền HIV trong cơ thể và làm chậm khởi phát các bệnh nhiễm trùng cơ hội, nhưng các thuốc này không ngăn ngừa được lây truyền HIV cho người khác.

Các thuốc ức chế men sao chép ngược ngoài nhân tế bào còn được gọi tắt theo tiếng Anh là NNRTIs (Non Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors).

Các thuốc ức chế men protease, còn được gọi tắt theo tiếng Anh là PIs (Protease Inhibitors). Các thuốc này làm gián đoạn việc nhân lên của virus vào giai đoạn muộn trong chu trình sống của virus