Hiện nay các trở ngại cơ bản nhất trong nuôi tôm càng xanh thương phẩm là:

- Con giống: Tập quán nuôi tôm càng xanh theo dạng truyền thống chủ yếu sử dụng con giống thu gom ngoài tự nhiên, nuôi theo dạng tận dụng diện tích ngập nước có sẵn. Hiện nay con giống ngoài tự nhiên suy kiệt dần không đủ cung cấp cho người nuôi, con giống sản xuất nhân tạo chưa nhiều, giá thành cao người nuôi theo dạng kinh tế phụ gia đình khó chấp nhận. Khắc phục vấn đề này là: bước đầu xây dựng mô hình nuôi bán thâm canh có hiện quả từ đó nhân rộng dần ra và có các dự án nuôi tôm càng xanh có một phần nhà nước hỗ trợ, khi nhu cầu con giống thực sự đòi hỏi việc sản xuất giống sẽ phát triển theo. Hiện nay kỹ thuật sản xuất giống không khó khăn lớn, việc giải quyết đầu ra ổn định, quanh năm mới là tiên quyết, còn việc giá thành tôm bột sản xuất nhân tạo cao, cũng giải quyết được bằng nâng cao tỷ lệ sống tôm bột, thay đổi một ít số lượng thức ăn Artemia bằng loại thức ăn khác.

- Tôm càng xanh thường có tập tính hay ăn thịt lẫn nhau, tỷ lệ sống khi nuôi thành tôm thịt thường thấp, thời gian nuôi dài. Cách khắc phục cung cấp thức ăn đầy đủ chất lượng và số lượng, tăng cường các giá thể trong ao làm chỗ trú ẩn cho tôm khi lột xác. Khi nuôi thương phẩm nên có thời gian ương, thả nuôi giống lớn 3-4 gr/con, sẽ rút ngắn thời gian nuôi.

- Tôm càng xanh có đặc điểm dị hình phái tính, con đực thường lớn hơn con cái, gấp 2-3 lần trong cùng thời gian nuôi. Có thể áp dụng trong nuôi thâm canh trong 2 tháng đầu nuôi mật độ cao, sau đó loại bỏ tôm cái chỉ giữ tôm đực, nuôi đạt hiệu quả cao hơn.

- Việc lựa chọn nuôi đơn tính trong tôm càng xanh khó thực hiện, việc sản xuất giống đon tính chưa thực hiện được, mới chỉ thành công trong phòng thí nghiệm (tại ISRAEL)