Trong quá trình chăn nuôi heo nái sinh sản, rất thường xảy ra việc loại thải nái sớm hơn dự kiến, tỉ lệ loại thải cao thấp do nhiều yếu tố quyết định và tỉ lệ thải của mỗi nhóm nguyên nhân cũng rất khác nhau. Một số nguyên nhân thường gặp buộc người chăn nuôi phải loại thải nái như sau:

- Nái không sinh sản:  vì một lý do nào đó, như: Dinh dưỡng, môi trường, vật chất,… làm cho nái rối loạn sinh sản hoặc không thể tiếp tục sinh sản. Tỉ lệ của nhóm nguyên nhân này chiếm rất cao (khoảng 30- 35% các nguyên nhân phải loại thải nái).

- Nái gặp trục trặc về chân móng: Một số nái giống con lớn, trọng lượng của lứa đẻ thứ 3-4 đạt khoảng 300kg. Vì vậy, nếu khẩu phần không tốt, nền chuồng có độ nhám độ dốc không tốt sẽ gây nên những tác hại đến sức chịu lực của chân và móng. Mặc dù sức khoẻ nái tốt, nhưng chân và móng không đáp ứng nhu cầu của trọng lượng thì nái cũng bị loại thải sớm.

- Nái chết do bệnh hoặc do các nguyên nhân khác.

- Nái bị viêm nhiễm và phát sinh các bệnh sau khi đẻ.

- Nái không đạt hiệu quả về năng suất và kinh tế