Cầu trùng là tên gọi chung của một nhóm bệnh, trong đó có khoảng 6 loài gây bệnh trên gà. mỗi loài cầu trùng tác động ở những đoạn ruột khác nhau, như loài cầu trùng Eimeria necatrix gây bệnh ở ruột non, loài Eimeria tenella gây bệnh ở manh tràng,.. và tuỳ thuộc vào loại cầu trùng gà đang nhiễm mà màu phân sẽ khác nhau. Ví dụ: khi đàn gà nhiễm cầu trùng ở đoạn trên của ruột non thì phân có màu vàng tươi, nếu nhiễm cầu trùng càng về phái dưới của đường ruột thì phân có màu vàng càng sậm hơn, khi nhiễm cầu trùng ở ruột già và manh tràng thì phân có kèm máu tươi. Như vậy phân có màu máu tươi hay phân có màu vàng sậm chỉ thể hiện loài cầu trùng mà gà đang nhiễm chứ không thể hiện mức độ bệnh của gà. Trong thực tế đa số người chăn nuôi khi thấy phân gà có kèm máu tươi thì cho rằng bệnh quá nặng, còn khi phân gà có màu vàng sậm thỉ cho rằng mức độ bệnh còn nhẹ. Điều này có ảnh hưởng đến hiệu quả điều trị bệnh và năng suất của gà.

Như 2 trường hợp nêu trên là gà đã nhiễm trừng ờ hai mức độ khác nhau. trường hợp thứ nhất, gà đang nhiễm cầu trùng ở phần trên hoặc phần giữa. của ruột non, mức độ bệnh khá nặng nên sức khoẻ của gà sụt giảm nhanh và gây chết nhiều. Trường hợp thứ hai gà đang nhiễm bệnh cầu trùng ở ruột già hoặc manh tràng nên phân cò kèm máu tươi, nhưng mức độ bệnh còn nhẹ, do sức khoẻ toàn đàn có ít sụt giảm và tỉ lệ chết thấp